Notícia

Genoma do câncer catalogado

Fonte

Universidade McGill

Data

segunda-feira, 10 fevereiro 2020 14:05

Áreas

Biologia Celular e Molecular. Genoma. Oncologia.

Uma equipe internacional de pesquisadores concluiu o estudo mais abrangente de genomas completos do câncer até o momento, melhorando significativamente o entendimento fundamental do câncer e sinalizando novas direções para seu diagnóstico e tratamento.

O Projeto de Análise Pan-Câncer de Genomas Completos (conhecido como Projeto Pan-Câncer) do ICGC-TCGA (PCAWG), uma colaboração envolvendo mais de 1.300 cientistas e clínicos de 37 países, analisou mais de 2.600 genomas de 38 tipos diferentes de tumores, criando um enorme recurso de genomas primários de câncer. Esse foi o ponto de partida para 16 grupos de trabalho que estudaram vários aspectos do desenvolvimento, causalidade, progressão e classificação do câncer.

Estudos anteriores se concentraram no 1% do genoma que codifica proteínas. O Projeto Pan-Câncer explorou em detalhes os 99% restantes do genoma, incluindo regiões-chave que controlam a ativação e desativação de genes.

Compartilhando recurso para pesquisa de genômica do câncer

O Projeto Pan-Câncer Project disponibilizou um recurso abrangente para pesquisa de genômica do câncer, incluindo dados brutos de sequenciamento do genoma, software para análise do genoma do câncer e vários sites interativos que exploram vários aspectos dos dados do Pan-Câncer Project.

O Projeto estendeu e avançou em métodos para analisar genomas de câncer, que incluíram computação em nuvem, e ao aplicar esses métodos ao seu grande conjunto de dados, descobriu novos conhecimentos sobre a biologia do câncer e confirmou importantes descobertas de estudos anteriores. Em 23 artigos publicados na revista Científica Nature e em seus periódicos afiliados, os pesquisadores do Projeto Pan-Câncer relatam que:

• O genoma do câncer é finito e conhecível, mas enormemente complicado. Ao combinar o sequenciamento de todo o genoma do câncer com um conjunto de ferramentas de análise, pode-se caracterizar todas as alterações genéticas encontradas em um câncer, todos os processos que geraram essas mutações e até a ordem dos principais eventos durante a história de vida de um câncer.
• Os pesquisadores estão quase catalogando todas as vias biológicas envolvidas no câncer e tendo uma visão mais ampla de suas ações no genoma. Pelo menos uma mutação causal foi encontrada em praticamente todos os cânceres analisados ​​e os processos que geram mutações foram muito diversos – desde alterações em letras únicas de DNA até a reorganização de cromossomos inteiros. Várias novas regiões do genoma que controlam como os genes são ligados e desligados foram identificadas como alvos de mutações causadoras de câncer.
• Por meio de um novo método de “datação por carbono”, os pesquisadores do Pan-Câncer descobriram que é possível identificar mutações que ocorreram anos, às vezes até décadas, antes do aparecimento do tumor. Isso abre, teoricamente, uma janela de oportunidade para a detecção precoce do câncer.
• Os tipos de tumor podem ser identificados com precisão de acordo com os padrões de alterações genéticas em todo o genoma, potencialmente auxiliando no diagnóstico do câncer de um paciente em que os testes clínicos convencionais não conseguiram identificar seu tipo. O conhecimento do tipo exato de tumor também pode ajudar a personalizar os tratamentos.

Acesse as principais páginas sobre os últimos avanços:

ICGC – Consórcio Internacional do Genoma do Câncer

TCGA – Atlas do Genoma do Câncer

PCAWG – PanCancer Analysis of Whole Genomes

Expression Atlas

PCAWG-Scout

Chromothripsis Explorer

Acesse a Edição Especial da revista Nature com os artigos sobre o Genoma do Câncer (em inglês).

Acesse a notícia completa na página da Universidade McGill (em inglês).

Fonte: Katherine Gombay, Universidade McGill. Imagem: Freepik.

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