Notícia

Perfil completo do genoma da leucemia linfoide crônica identifica novos subgrupos de câncer no sangue

Fonte

Universidade de Oxford

Data

terça-feira, 8 novembro 2022 06:15

Áreas

Bioinformática. Biologia. Computação. Genoma. Hematologia. Medicina de Precisão. Microbiologia. Oncologia. Saúde Pública.

Um estudo colaborativo liderado pela Universidade de Oxford, no Reino Unido – como parte do Projeto 100.000 Genomas – definiu cinco novos subgrupos do tipo mais comum de câncer no sangue, a leucemia linfoide crônica (LLC), e os associou a resultados clínicos. Este novo método de estratificação de risco de pacientes pode levar a um atendimento mais personalizado ao paciente. O estudo foi publicado na revista científica Nature Genetics.

Este é o primeiro estudo a analisar todas as mudanças relevantes no DNA em todo o genoma do câncer, em vez de regiões-alvo, para classificar pacientes com câncer e vincular esses subgrupos a resultados clínicos.

A Dra. Anna Schuh, professora do Departamento de Oncologia de Oxford, que liderou o estudo, disse: “Sabemos que o câncer é fundamentalmente uma doença causada por mudanças no DNA que são adquiridas ao longo da vida de um indivíduo. As ferramentas de laboratório que usamos atualmente para prever se um paciente provavelmente responderá ou não a uma determinada terapia geralmente se concentram em anormalidades únicas no DNA do câncer e não predizem com precisão o resultado clínico do paciente. É por isso que fizemos a pergunta simples: podemos aumentar a precisão dos testes atuais observando todas as alterações de DNA adquiridas no câncer de uma só vez?”

O estudo analisou todas as sequências do genoma de 485 pacientes com LLC que foram inscritos em estudos clínicos nacionais liderados pela Universidade Liverpool e pela Universidade de Leeds, que forneceram amostras para o UK LLC Biobank em Liverpool e consentiram que suas amostras fossem usadas no Projeto 100.000 Genomas administrado pela Genomics England. Ao comparar todos os dados de sequenciamento do genoma do câncer e tecidos saudáveis ​​nesses pacientes, a equipe conseguiu mapear alterações de DNA conhecidas e recém-identificadas, alterações estruturais, assinaturas mutacionais de câncer e outras medidas globais associadas à LLC em todo o genoma. Eles identificaram 186 alterações genômicas distintas e recorrentes e as usaram para definir cinco subgrupos genômicos de LLC que se associam a diferentes desfechos clínicos.

Após validação adicional em pacientes que recebam uma gama mais ampla de tratamentos do que os incluídos neste estudo, particularmente terapias direcionadas, esses novos subgrupos genômicos para LLC podem ser usados ​​para orientar melhor a seleção de terapias para melhorar os resultados dos pacientes. O estudo abre caminho para a aplicação clínica de rotina de análises de genoma completo para estratificação de risco em outros tipos de câncer.

A análise da equipe também identificou 148 novos drivers genéticos putativos da LLC. Pesquisas futuras sobre esses fatores podem descobrir novos mecanismos na iniciação e progressão da LLC, com potencial para o desenvolvimento de novas terapias.

O professor Sir Mark Caulfield, vice-diretor de saúde da Queen Mary University of London e ex-cientista-chefe e líder do Projeto 100.000 Genomes na Genomics England destacou: “Esta é a maior análise genômica internacional desse câncer no sangue, que demonstra de forma enfática o valor real do sequenciamento do genoma completo do Projeto 100.000 Genomas. Ele também aproveita as amostras de câncer de sangue de alta qualidade do Liverpool Chronic Lymphocytic Leukemia Biobank e dados clínicos associados coletados pelas Unidades de Ensaios Clínicos das universidades de Liverpool e Leeds como parte de ensaios clínicos multicêntricos apoiados pelo National Cancer Research Institute. Nosso trabalho mostrou que todo o genoma é superior na classificação de pacientes em grupos em comparação com as abordagens convencionais direcionadas e que podemos prever a resposta ao tratamento com mais precisão e em mais pacientes”.

“Este estudo inovador é um paradigma para o que pode ser alcançado através de uma abordagem coordenada nacionalmente para o trabalho colaborativo que permite a aplicação da ciência de ponta a um grande número de amostras de alta qualidade obtidas de coortes de pacientes uniformes e bem definidas e vinculadas a dados de resultados clínicos de alta qualidade”, concluiu o professor Dr. Andrew Pettitt, diretor fundador do UK LLC Biobank e pesquisador-chefe de dois dos ensaios clínicos colaborativos.

Acesse o artigo científico completo (em inglês).

Acesse a notícia completa na página da Universidade de Oxford (em inglês).

Fonte: Universidade de Oxford. Imagem: kjpargeter via Freepik.

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